Chroma是Generate Bio开发一款蛋白设计算法，可以支持做骨架设计和序列设计。与Baker团队开发的RFdiffusion有一定相似之处。

开源代码: https://github.com/generatebio/chroma

论文地址：Illuminating protein space with a programmable generative model

这篇文章pipeline的核心工具是colabdesign（Sergey Ovchinnikov团队研发，故而Sergey作为BindCraft的共同通讯），利用colabdesign提供的afdesign模块和proteinMPNN模块，进行binder design。

原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.09.30.615802

代码链接：https://github.com/martinpacesa/BindCraft

算法部署

一、高斯混合模型

对一一组没有任何干扰差异的样本，其特征分布从统计学来说只受随机因素影响，服从单一分布。经典的单一分布就是高斯分布：

一、概述

微软的windows系统内置了远程桌面功能，可以让用户像访问本地电脑一样访问局域网内的远程电脑。相比于teamview等第三方远程桌面服务，具有以下独特优势：

• windows内置系统服务，开机自动运行，无需解锁登录。
• windows原生产品，无需额外安装。
• 与系统深度融合，远程与本地的资源共享便利。

一、远程桌面概述

windows自带的远程桌面（remote destop）服务能够让用户便利的远程控制电脑。因为是微软的系统服务，与市面上的一些第三方远程桌面工具如teamviewer、向日葵和rustdesk等相比，具有独特的使用优势。其基本要求如下：

• 远程电脑Windows 10/11专业版及以上
• 远程电脑防火墙开放远程控制端口3389
• 本地电脑可以连同远程电脑，即在相同局域网内，且知道远程电脑IP
  用户可以在系统设置中开启远程桌面功能。同时用户可以通过下列命令修改远程桌面默认端口，例如使用3390。

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  # 修改远程桌面端口 Set-ItemProperty -Path 'HKLM:\SYSTEM\CurrentControlSet\Control\Terminal Server\WinStations\RDP-Tcp' -name "PortNumber" -Value 3390; # 删除旧的进站规则 Remove-NetFirewallRule -DisplayName 'RDPPORT'; # 修改防火墙进站规则给新端口放行 New-NetFirewallRule -DisplayName 'RDPPORT' -Profile 'Any' -Direction Inbound -Action Allow -Protocol TCP -LocalPort 3390 -RemotePort Any -Enabled True;

  然后就可以通过内置应用“远程桌面连接”来连接目标电脑。其他RDP细节问题本文不做介绍，本文目的在于介绍内网穿透配合RDP实现跨局域网访问。

gitbook基础

gitbook是一个电子书构建工具，这是它的help文档。可以在gitbook在线编写，也可以按照规范使用gitbook-cli。注意它和git没什么关系。就像java和Javascript一样。可以参考git电子书的样式。

安装gitbook

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npm install gitbook-cli -g

创建gitbook

和vue-cli等脚手架类似，可以创建一个基础项目。

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gitbook init project-name

构建gitbook

和hexo很像。

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gitbook build
gitbook serve

一、Maven概述

Maven是Apache开源基金会旗下孵化的一个包管理器，在java开发中有着广泛的应用。java开发者开发了大量的jar包形成了java开发的生态。和Python的pip和conda一样，maven负责安装与管理这些第三方库。

maven安装

比较容易，主要是以下几步

• 去官网下载
• 解压到你的安装目录（即为免安装版本）
• 配置该安装目录为MAVEN_HOME环境变量
• 同时将%MAVEN_HOME%\bin追加到PATH环境变量，如果是Linux，则为$MAVEN_HOME/bin。

一、概述

tkinter是python内置的GUI编程库，可以实现许多基础的GUI编程。python -m tkinter能够查看tkinter的版本信息的GUI页面。下例是tkinter实现的一个hello world。

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import tkinter as tk
class MainWindow(tk.Tk):
    def __init__(self, title: str, width:int, height:int) -> None:
        super().__init__()
        self.title(title)
        self.geometry(f"{width}x{height}")
        self.label = tk.Label(self, text="Hello world")
        self.label.pack()

MainWindow("Tk GUI", 800, 600).mainloop()

vscode集成终端

vscode集成终端（integrated terminal）是vscode运行各类程序的内置终端，也是除了编辑器本身外最重要而好用的功能。vscode提供了一系列集成终端的配置，大都以terminal.integrated开头，用户可以在${workspaceRoot}/.vscode/settings.json}为当前文件夹配置，或者在用户vscode配置路径下的settings.json进行全局配置。

自定义环境变量

编写程序离不开各类环境变量的配置，例如连接器需要LD_LIBRARY_PATH，Python寻库需要PYTHONPATH等，而这些变量有时候只是需要临时或者是针对当前项目进行设置，这在idea等IDE中往往是不需要用户直接配置的。而vscode作为一个轻量级编辑器，它给用户以极大自由的同时，就需要用户学会自主配置。vscode环境变量配置有两种类型，一种是在launch.json中给指定命令配置env参数，这样的配置适合指定的任务，如gcc编译等，但不直接修改集成终端中的变量。第二种方式如下，可以在启动集成终端是自动加载，十分方便。

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{
    "terminal.integrated.env.windows": {
        "PYTHONPATH": "${workspaceFolder}\\src;${env:PYTHONPATH}}",
    }
}

1. HLS(m3u8，ts)合并转MP4

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# merge by m3u8 list file
ffmpeg -i path/to/file.m3u8  -codec copy -f mp4 output.mp4

# merge by specific serveral TS file
ffmpeg -i "1.ts|2.ts|3.ts|4.ts" -codec copy -f mp4 output.mp4

2. MP4转m3u8

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# Convert to a merged TS file first
ffmpeg -i input.mp4 -codec copy output.ts

# Seperated it and named with format v%04d.ts
ffmpeg -i output.ts -codec copy -map 0 -f segment -segment_list target/path/to/file.m3u8 -segment_time 5 target/path/to/v%04d.ts